Το πρωτόκολλο μεταφοράς αρχείων (FTP, File Transfer Protocol) είναι από τα παλαιότερα πρωτόκολλα του Διαδικτύου και χρησιμοποιείται για την ανταλλαγή αρχείων μεταξύ υπολογιστικών συστημάτων. Στο Τμήμα λειτουργεί υπηρεσία FTP, η οποία επιτρέπει τόσο την ανώνυμη (με χρήση οποιασδήποτε εφαρμογής περιήγησης), όσο και την εξουσιοδοτημένη πρόσβαση (μέσω ειδικού λογισμικού).
